Archive pour 6 septembre 2009

Toulouse – Analyse de transport et transfert par convection-diffusion en vaisseaux

http://www.imft.fr/recherche/gemp/theme1/operation14.html

Ce travail est une collaboration avec C. Pierre du Département de mathématiques appliquées de l’Université de Pau. L’analyse du transport de constituants dans des réseaux aussi compliqués que ceux illustrés dans l’opération  Imagerie et analyse statistique de réseaux micro-vasculaires nécessite une modélisation des phénomènes de convection/diffusion qui opèrent à l’échelle d’un vaisseau. C’est pourquoi de nombreux modèles ont en effet été développés à cette fin dans différents domaines d’application
comme l’ingénierie biomédicale, le génie chimique ou les milieux poreux. La validité de ces modèles, eu égard aux différents paramètres décrivant le transport, les conditions aux limites, et la diffusion est cependant très rarement analysée, et a fortiori démontrée. Dans ce contexte nous avons travaillé sur l’application de la méthode de prise de moyenne volumique, qui permet d’établir des équations modèles pour le problème de convection/diffusion dans un tube. Nous avons proposé une version étendue de la méthode, et nous avons pu montrer en quel sens, et de quelle manière, celle-ci permet d’établir rigoureusement des modèles macroscopiques de transport. Nous avons en particulier étudié la dépendance de la méthode en fonction de différentes classes de conditions aux limites (C. Pierre et al. 2005). Ce travail a notamment permis d’éclairer la complémentarité de cette méthode avec celle précédemment proposée par Balakotaiah & Chang.

Nous avons par ailleurs étudié l’analyse du transport par convection diffusion couplé avec un domaine solide pour mieux comprendre les couplages entre tissus et vaisseaux. Nous avons essentiellement étudié la limite pleinement développée du problème de convection diffusion pour lequel nous avons proposé une dérivation asymptotique (Plouraboué & Pierre, 2007).

Publications récentes

C. Pierre, F. Plouraboué & M. Quintard, Convergence of generalized volume averaging method on a convection-diffusion problem : a spectral perspective, SIAM J. App. Math, 66, 1, 122-152, 2006.

F. Plouraboué & C. Pierre, Stationary convection-diffusion between two co-axial cylinders, Int. J. Heat Mass Trans., 50, 4901-4907, 2007.

C. Pierre, F. Plouraboué, M. Quintard, Coupled convection-diffusion in a simple heat-pipe tube: fully-developed solution and volume averaging theory, Proceedings of the International Conference on Computational heat transfer, Paris, France, 2005.

Toulouse – Maladies cérébro-vasculaires – sténose – stimulation tube section variable

http://www.imft.fr/recherche/gemp/theme1/operation11.html

Animatrice : S. Lorthois

Les infarctus cérébraux sont une des grandes causes mondiales de mortalité et de handicaps. Dans un nombre important de cas, ils sont dus à l’existence d’une sténose (i.e. un rétrécissement localisé) de l’artère carotide interne. A l’heure actuelle, une opération chirurgicale visant à retirer l’artère sténosée est envisagée si le degré de sténose (pourcentage de rétrécissement) est supérieur à 80%. L’Angiographie par Résonance Magnétique (ARM), non invasive, est de plus en plus utilisée pour visualiser la morphologie des artères carotides et évaluer la sévérité des sténoses carotidiennes. Cependant, les structures d’écoulement (zones de recirculations, jets) peuvent induire la présence d’artéfacts. Par exemple, la perte de signal observée en amont et en aval du col des sténoses rend la différenciation entre une sténose sévère et une occlusion difficile voire impossible.

La simulation numérique d’angiographies par résonance magnétiques (ARM) est un outil pouvant aider à la compréhension des mécanismes de production artéfactuelle et aux choix des séquences d’imagerie les plus adaptées pour les minimiser. En formulation Eulerienne, cette simulation implique le calcul du champ des vitesse par résolution numérique des équations de Navier-Stokes puis le calcul du champ d’aimantation par résolution numérique des équations de transport de Bloch. La procédure de construction de l’image, basée sur l’analyse de la distorsion de l’espace physique vers l’espace de l’image, est complexe et lourde à mettre en œuvre numériquement. Nous nous sommes intéressés à simplifier cette procédure par une approche analytique reproduisant l’algorithme de reconstruction de l’image mis en œuvre par les appareils d’ARM (codage spatial du signal puis transformée de Fourier inverse bidimensionnelle). Cette approche analytique simple a été appliquée au cas de la bifurcation carotidienne sévèrement sténosée de géométrie anatomique réaliste. Les résultats ont été comparés avec des expériences réalisées dans un fantôme (moulage silicone) de géométrie identique dans des conditions analogues (collaboration avec D. Saloner et L.D. Jou du Department of Radiology, UC San Francisco). En particulier, les simulations numériques ont permis de clarifier les conditions d’imagerie maximisant et minimisant le degré de sténose évalué par ARM [Lorthois et al., Annals of Biomed Eng, 2005].

En parallèle, en collaboration avec le LMM (P.Y. Lagrée) , nous avons poursuivi les travaux engagés pendant la précédente période concernant l’évaluation de la contrainte de cisaillement pariétale dans une artère sténosée. Nous avons en particulier montré que, dans le cas d’un tube à section variable, le système d’équations « RNS/Prandtl » inclue au premier ordre diverses descriptions asymptotiques des équations de Navier-Stokes et qu’il est donc bien adapté pour décrire la transition entre ces différents descriptions [Lagrée et Lorthois, Int J of Eng Science, 2005]

Publications récentes

S. Lorthois, P.-Y. Lagrée, J.-P. Marc-Vergnes et F. Cassot. « Maximal wall shear stress in arterial stenoses : application to the internal carotid arteries », Transactions of the ASME : Journal of Biomechanical Engineering, 2000, 122 : 661-666.

S. Lorthois, et P.-Y. Lagrée. « Ecoulement dans un convergent axisymétrique : calcul de la contrainte de cisaillement pariétale maximale », Comptes rendus de l’Académie des Sciences, Série IIb, 2000, 328(1) : 33-40.

S. Lorthois, J.S. Stroud-Rossman, S.A Berger, L.D. Jou and D. Saloner. « Numerical simulation of Magnetic Resonance Angiographies of an anatomically realistic stenotic carotid bifurcation », Annals of Biomedical Engineering, 2005 : 33, 270-283.

P.Y. Lagrée et S. Lorthois. « The RNS Prandtl equations and their link with other asymptotic descriptions : application to the wall shear stress scaling in a constricted pipe », International Journal of Engineering Science, 2005 : 43, 352-378.


toulouse Imagerie et analyse statistique de réseaux micro-vasculaires

Imagerie et analyse statistique de réseaux micro-vasculaires

http://www.imft.fr/recherche/gemp/theme1/operation12.html

Ce travail s’est effectué dans le cadre de plusieurs projets sélectionnés et soutenus par l’European Synchrotron Radiation Facilities (ESRF) en collaboration avec C. Fonta du CERCO (UMR CNRS –UPS 5549) et se poursuit dans le cadre de l’ANR-06-BLAN-0238 «Micro-réseau» en collaboration avec l’INRIA Sophia-Antipolis et l’ESRF.

Notre travail a tout d’abord consisté à mettre au point un nouveau protocole expérimental pour l’imagerie tri-dimensionnelle haute résolution de réseaux micro-vasculaires (Plouraboué et al. 2004). Les différentes étapes de cette méthode de préparation sont :

– L’injection de l’ agent de contraste dans l’ensemble du réseau vasculaire
– La préparation et le conditionnement des échantillons biologiques

– L’imagerie par tomographie synchrotron rayon X

L’avantage de l’utilisation des rayons X synchrotrons par rapport à d’autres techniques, comme par exemple la microscopie confocale, est d’imager des volumes considérables (une dizaine de millimètres cubes) avec une résolution spatiale de l’ordre du micron. Cette méthode nous a permis d’obtenir des images 3D de l’ensemble de la vascularisation de la substance grise de cortex de singe Marmousset (Cf figure ci dessus) et de rats sur une profondeur de l’ordre de quelques millimètres. Nous avons alors procédé à l’analyse de ces images dans le cadre de la thèse de Laurent Risser. En haut une image en rendu volumique de micro-réseaux vasculaires extrait du cortex d’un singe Marmousset. La résolution spatiale est de 1.4 microns, les barrres d’échelle en rouge de 100 microns dans chaques directions de sorte que la hauteur totale de l’échantillons correspondant à l’image est d’environ 2 mm. La figure du bas illustre les résultats obtenus avec une méthode de compteur de boites pour l’analyse fractale 3D de la densité vasculaire. On distingue nettement deux « régimes » pour la distribution de la densité. Un premier régime fractal à petite échelle et un second régime homogène partir d’une échelle proche de 40 microns. Figures extraites de Risser et al, 2007. Ce travail a permis de mettre en évidence les différences structurelles entre réseaux micro-vasculaires corticaux sains et tumoraux.

Un premier résultat d’analyse fractale de la densité vasculaire est illustré sur la figure ci-dessus, où l’on a représenté en coordonnées bi-logarithmiques l’évolution du nombre de boites en fonction de l’échelle considérée. Ce résultat indique la présence d’une distribution multi-échelle de dimension fractale égale à 2.1 de la densité vasculaire sur une gamme de un à quarante microns. Au delà de cette échelle, la densité vasculaire évolue comme celle d’un objet homogène. Quarante microns représente donc ici l’échelle d’un volume élémentaire représentatif pour la densité vasculaire. Cette mesure est à notre connaissance la première mesure directe de cette quantité à partir d’images 3D sur des réseaux micro-vasculaires corticaux (L. Risser et al., 2007).

Nous avons de plus développé des outils d’analyse d’image pour la squelettisation, le post-traitement et la numérisation automatique d’images de tomographie synchrotron. Ces outils permettent en particulier de traiter le problème du raccordement automatique des segments capillaires disconnectés (L. Risser et al, 2008).

Publications

F. Plouraboué, P. Cloetens, C. Fonta, A. Steyer, F. Lauwers & J. P Marc-Vergnes, High resolution X-ray Imaging of vascular networks, J. Microscopy, 215, 2, 139-148, 2004.
L. Risser, F. Plouraboué, A. Steyer, P. Cloetens, G. Le Duc & C. Fonta, From homogeneous to fractal normal and tumorous micro-vascular networks in the brain, 27, 2, J. Cereb. Blood flow and Metabolism, 2007.
L. Risser, F. Plouraboué & X. Descombes, Gap Filling of 3-D Micro-vascular Networks by Tensor Voting, to appear in IEEE Transactions in Medical imaging , 2008.
F. Plouraboué, P. Cloetens, A. Steyer, F. Lauwers and J. P Marc-Vergnes, X-ray tomography of human brain cortical vascular network, In Proceedings of the 6th biennial conference on High resolution X-Ray diffraction and imaging, Grenoble, France, 2002.
F. Plouraboué, P. Cloetens, A. Steyer, F. Lauwers and J. P Marc-Vergnes, X-ray tomography of human brain cortical vascular network, In Proceedings of microcirculation congress, Toulouse, France, 2002.
F. Plouraboué, P. Cloetens, A. Steyer, F. Lauwers and J. P Marc-Vergnes, X-ray tomography of human brain cortical vascular network, In Proceedings of the 6th biennial conference on High resolution X-Ray diffraction and imaging, Grenoble, France, 2002.
L. Risser, F. Plouraboué, P. Cloetens, C. Fonta, Cortical variations of vascular density : a 3D investigation, Human Brain Mapping conference, Chicago, USA, June 2007

toulouse – Microcirculation : relations structure/fonction et imagerie fonctionnelle

http://www.imft.fr/recherche/gemp/theme1/operation13.html

Le couplage entre l’activité neuronale et l’hémodynamique microvasculaire est réalisé par une variation active du diamètre des artérioles nourricières. Ce couplage est à la base des techniques d’imagerie fonctionnelle cérébrale qui ont permis, depuis une dizaine d’années, des progrès importants dans l’étude des fonctions cognitives du cerveau humain. En effet, ces techniques reposent sur la mesure indirecte de paramètres liés à l’hémodynamique. Dans ce contexte, dans le cadre de l’ACI Technologies pour la Santé 02TS031, en collaboration avec l’INSERM U455 et le Laboratoire de Physique de la Matière Condensée (UMR 7643), notre objectif à long terme est de comprendre l’effet des variations de diamètre des artérioles nourricières sur l’hémodynamique microvasculaire à l’échelle du volume élémentaire de mesure de ces techniques d’imagerie. Les difficultés proviennent de la complexité de la microcirculation, dont la caractéristique principale est la très grande hétérogénéité à toutes les échelles caractéristiques de l’architecture et du transport microvasculaire.

Evolution temporelle de l’aimantation à l’échelle microscopique (Imagerie par Résonance Magnétique fonctionnelle) : nous avons proposé une approche analytique originale permettant d’obtenir des solutions analytiques, complètes ou asymptotiques, de l’évolution spatiale et temporelle de l’aimantation à l’échelle du vaisseau capillaire, puis d’en déduire sa résultante spatiale (grandeur mesurée en IRMf). Le cas de référence simple d’un capillaire cylindrique infini de susceptibilité magnétique uniforme (et dépendant de la concentration en hémoglobine) dans un milieu infini de susceptibilité constante, soumis à un champ magnétique extérieur appliqué, a été considéré. Dans ce cas, l’expression des inhomogénéités de champ magnétique induites par la discontinuité de susceptibilité est connue. L’équation qui régit le transport de l’aimantation est l’équation de Bloch-Torrey, qui inclue les termes classiques de diffusion et convection auxquels s’ajoutent un terme de précession autour du champ magnétique local et un terme de relaxation. Cette équation a été simplifiée par moyennage temporel sur la période de précession des spins, puis par des arguments dimensionnels, et résolue analytiquement par la méthode des fonctions de Green. L’analyse asymptotique de la solution a permis d’obtenir l’expression analytique d’un champ inhomogène équivalent aux temps longs (t > 500 ms), dû à la diffusion des protons [Castets et al, Arch Physiol Biochem, 2004].

Ecoulement sanguin à l’échelle du réseau microvasculaire : les modèles numériques unidimensionnels non-linéaires de l’écoulement sanguin dans la microcirculation ont été développés et validés expérimentalement, in vivo chez l’animal, depuis une quinzaine d’années, pour des réseaux de petite taille. Dans ces modèles, l’hétérogénéité architecturale constitue une donnée de la simulation. L’hétérogénéité dynamique est représentée par des lois phénoménologiques décrivant les comportements rhéologiques non linéaires de la microcirculation. Nous avons adapté ces modèles pour pouvoir traiter des réseaux de grande taille (40 000 segments). Ces améliorations ont permis la simulation de l’écoulement dans un réseau microvasculaire humain (données morphométriques fournies par F. Cassot, INSERM U455) [Lorthois et al. Journal of Vascular Research, 2006]. Parallèlement, en collaboration avec Vincent Fleury du Laboratoire de Physique de la Matière Condensée (UMR 7643) puis du GMCM à Rennes, nous avons travaillé, à partir du modèle de morphogénèse vasculaire initialement proposé par Vincent Fleury, sur la génération automatique de réseaux modèles quasi-bidimensionnels, intermédiaires entre arbres et maillages, dont la densité vasculaire et le taux de présence d’anastomose (connections directes entre artérioles et veinules) peuvent être contrôlés, ainsi que le nombre d’artérioles terminales et de veinules principales (modèles stochastiques d’angiogenèse, adaptés des modèles de croissance laplacienne). Après construction de la matrice de connectivité de ces réseaux modèles (matrice creuse 40 000 x 40 000 pour un réseau construit sur 200 x 200 capillaires), la simulation de l’écoulement a été mise en œuvre. Le travail en cours sur ces deux types de réseaux concerne l’influence des conditions aux limites imposées ainsi que l’influence des paramètres empiriques décrivant l’effet de ségrégation de phase. Les perspectives à court terme sont l’étude des territoires vasculaires associés aux artérioles et veinules principales ainsi que l’influence d’une variation de diamètre d’une ou plusieurs artérioles sur l’étendue de ces territoires et sur les variations des paramètres intégrés (moyenne et distribution statistique de l’hématocrite, débit tissulaire, temps de transit moyen, résistivité globale, …).

Morphogenèse vasculaire : La morphologie finale des réseaux générés automatiquement en collaboration avec V. Fleury est très dépendante des conditions aux limites imposées, notamment de la position des rudiments artériels et veineux. Pour progresser vers une modélisation tridimensionnelle qui puisse être représentative de l’architecture de la circulation cérébrale, nous nous sommes donc focalisés sur la détermination des conditions aux limites et de leurs modifications lors du développement embryonnaire du cerveau. Pour cela, nous avons observé le développement de la vasculature du cerveau chez l’embryon de poulet. Nous avons montré que, comme dans le cas du sac vitellin, la chronologie de la morphogenèse vasculaire est complexe. Les artères sont les premières à se développer. Puis, une première arborescence veinulaire apparaît, dans un territoire distinct du territoire artériel (configuration cis-cis). Enfin une seconde arborescence veinulaire apparaît, qui se développe en parallèle à l’arborescence artérielle (configuration cis-trans). Nous avons expliqué ce phénomène de transition vasculaire en démontrant qu’il est dû au remodelage mécanique du réseau capillaire à proximité des grosses artères déconnectées de ce réseau, contrairement à notre idée initiale qui se focalisait sur l’influence des conditions aux limites. Nous avons par ailleurs montré que la transition de la configuration cis-cis, initialement moins résistive, à la configuration cis-trans, initialement plus résistive, est liée à la croissance de l’organe et aux gradients de contraintes dans le tissu interstitiel générés par cette croissance. Nous avons présenté un modèle mécanistique simple permettant d’évaluer la taille de l’organe à partir de laquelle se produit cette transition et affiné ce modèle mécanistique par des simulations numériques de type « réseau » dans des vasculatures idéalisées d’organes en croissance [Al-Kilani et al. Physical Review E, à paraître]. Les résultats obtenus dépassent le cadre initialement prévu dans ce travail puisqu’ils apportent un éclairage nouveau sur le rôle des facteurs mécaniques dans la morphogenèse vasculaire, plus particulièrement dans le cadre de la controverse sur le rôle respectif des facteurs génétiques et épigénétiques dans la différentiation artério-veineuse. La prise en compte, dans le modèle de morphogenèse vasculaire développé par V. Fleury, du remodelage mécanique du réseau capillaire à proximité des grosses artères déconnectées de ce réseau reste cependant à réaliser pour que ce modèle soit capable de prédire la transition observée. Cette étape, indispensable à la génération automatique de réseaux tridimensionnels, est encore inachevée.

Dispersion de traceur en milieu poreux à matrice diffusante : une étude expérimentale portant sur la dispersion de traceur en milieu poreux à matrice diffusante (micro-canaux dans un hydrogel) a débuté, dans le contexte de la mesure clinique du débit sanguin cérébral par Tomographie à Emission de Positrons (TEP) [Billanou et al., Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering, à paraître].

Etude de la ségrégation de phase au niveau d’une bifurcation divergente : Cf thème Microhydrodynamique.

Publications récentes

M. Castets, S. Lorthois et F. Cassot : « Toward a model of the BOLD effect accounting for microvascular heterogeneity », Archives of Physiology and Biochemistry 2004 ; 112 (Supplement September), p94 (A).

S. Lorthois, F. Cassot et F. Lauwers : « Numerical simulation of blood flow in large microvascular networks of the human cerebral cortex : hemodynamic variations induced by arteriolar vasodilations », Journal of Vascular Research 2006 ; 43(S1), p42 (A).

I. Billanou, P. Duru, S. Lorthois, D. Bourrier and M. Dilhan. “Flow of concentrated red blood cells suspensions in micro-channels : experimental techniques”. CD-ROM du 3ème Congrès Français de Microfluidique 2006 ; 10 pages.

I. Billanou, S. Lorthois et M. Quintard. “A new experimental set-up for the study of tracer exchange between a network of channels and a diffusive matrix: application to kinetic modeling in PET. » à paraître dans Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering.

A. Al-Kilani, S. Lorthois,  T.-H. Nguyen, F. Le Noble,  A. Cornelissen,  M. Unbekandt,  O. Boryskina, L. Leroy and V. Fleury. “During vertebrate development, arteries exert a morphological control over the venous pattern through physical factors”, à paraître dans Physical Review E.


Thèse en cours

I. Billanou, Modélisation expérimentale et théorique pour la quantification du débit sanguin par Tomographie à Emission de Positrons (TEP). Thèse financée par l’Institut de Recherche Pierre Fabre et la Région Midi-Pyrénées.


Plouraboué toulouse biomécanique « brain circulation »

http://www.imft.fr/recherche/gemp/theme1.html

Responsables : S. Lorthois, F. Plouraboué

Présentation générale

La biomécanique constitue un vaste champ d’investigation mettant en jeu des problématiques complexes à l’interface de la mécanique, de la physique et de la biologie. Dans ce contexte, les opérations de recherches menées au sein du groupe GEMP se focalisent sur des thématiques qui peuvent être enrichies par l’adoption du point de vue de la mécanique et de la physique des milieux hétérogènes. Ce point de vue nous a conduit à développer et/ou à appliquer des outils d’analyse et de modélisation mettant en jeu des constituants biologiques. Ces outils peuvent être de nature expérimentale, numérique ou théorique. Dans tous les cas, leur caractère pluri-disciplinaire place naturellement nos activités dans le cadre de collaborations avec différentes équipes de compétences complémentaires. Ces collaborations, mentionnées ci après pour chacune des opérations de recherches, ont pour la plupart été menées dans un cadre institutionnel plus large, notamment le GDR 2760 « Interactions Fluides Structures Biologiques », auquel sont aussi associés d’autres groupes du laboratoire.

Opérations de recherche

Toulouse – Sylvie LORTHOIS – Institut de Mécanique des Fluides de Toulouse // neuro

Sylvie LORTHOIS

http://www.imft.fr/page_perso/lorthois/index.html

Chargée de Recherche CNRS
Institut de Mécanique des Fluides de Toulouse (UMR CNRS 5502)
Groupe d’Etude sur les Milieux Poreux

Mail : lorthois@imft.fr
Tel : (33) 5 61 28 58 74
Fax : (33) 5 61 28 59 93

Octobre 2001 : Chargée de Recherches CNRS

Activités de recherche :

Mes travaux ont porté sur différents aspects biomécaniques des micro- ou macrocirculations cérébrales. Ils ont fait l’objet d’une approche pluridisciplinaire associant les concepts et les outils de la Mécanique des Fluides à des interrogations de portée médicale, concernant principalement l’imagerie fonctionnelle cérébrale et la physiopathologie des maladies cérébrovasculaires.

Depuis Octobre 2001, je m’intéresse aux relations structure / fonction en microcirculation et aux implications concernant l’Imagerie fonctionnelle cérébrale. Dans ce cadre, afin de mieux comprendre l’architecture des réseaux microvasculaires cérébraux matures, je m’intéresse à la morphogenèse de ces réseaux.

Haut de page

Encadrement (Masters et Doctorants) :

Isabelle GILLIERON : Stage de DEA de Dynamique des Fluides, Université Paul Sabatier (2002) : « Etude théorique du transport de l’aimantation dans un microvaisseau soumis à un champ magnétique temporellement variable ». Encadrement à 90% en collaboration avec F. Cassot.
Tania EGUIENTA : Stage de Master Recherche de Dynamique des Fluides, Ecole Nationale Supérieure de Construction Aéronautique (2005) : « Simulation de l’écoulement sanguin micro-vasculaire dans des réseaux de grande taille ». Encadrement à 90% en collaboration avec F. Cassot.
Ian BILLANOU : Stage de Master Recherche,  Ecole Polytechnique Universitaire de Marseille (2006) : « Etude expérimentale de l’écoulement sanguin en microcanaux ». Encadrement à 50% en collaboration avec P. Duru.

Mélanie CASTETS : Doctorat de Dynamique des fluides, INPT (2003-2005) : « Transport de l’aimantation dans la microcirculation sanguine cérébrale : Application à l’Imagerie par Résonance Magnétique fonctionnelle (IRMf) ». Encadrement à 90% en collaboration avec F. Cassot.
Gaëlle GUILLEMOT : Thèse SEVAB au Laboratoire de Biologie et Bioprocédés (2003-2006) : « Compréhension des mécanismes à l’origine de l’adhésion de Saccharomyces cerevisiae sur acier inoxydable. Implications pour l’hygiène des surfaces en industrie agroalimentaire ». Encadrement à 10% en collaboration avec Ph. Schmitz et M. Mercier-Bonin.
Matthieu ADOUE : Thèse SEVAB au Laboratoire de Biologie et Bioprocédés (2004-2007) : « Etude de la formation du film primaire en milieu marin : incidence sur l’adhesion des micro organismes ». Encadrement à 10% en collaboration avec Ph. Schmitz et M. Mercier-Bonin.
Ian BILLANOU : Doctorat de Dynamique des Fluides, INP Toulouse : « Modélisation expérimentale et théorique pour la quantification du débit sanguin par Tomographie à Emission de Positrons (TEP) ». Financement Pierre Fabre – Région Midi-Pyrénées. Encadrement à 70% en collaboration avec M. Quintard et P. Duru.

Haut de page

Collaborations Passées et Présentes :

INSERM U825 « Imagerie cérébrale et handicaps neurologiques », Toulouse
(F. Cassot, F. Lauwers, J.P. Marc-Vergnes, P. Celsis)
Matière et Système Complexes (UMR CNRS 7057), Paris
(V. Fleury, A. Cornelissen)
Institut de Recherches « Pierre Fabre », Toulouse
(J.M. Lagarde, D. Black)
Laboratoire d’Architecture et d’Analyse des Systèmes (UPR CNRS 8001), Toulouse
(M. Dilhan, D. Bourrier)
Laboratoire d’Ingénierie des Systèmes et des Procédés Biologiques (UMR CNRS 5504), Toulouse
(Ph. Schmitz, M. Mercier-Bonin)
Laboratoire de Modélisation en Mécanique (UMR CNRS 7607), Paris
(P.Y. Lagrée)
Department of Mechanical Engineering, UC Berkeley
(Prof. S.A. Berger)
Department of Radiology, UC San Francisco
(D. Saloner, L.D. Jou)
INSERM U143 « Hémostase, Biologie Vasculaire », Le Kremlin-Bicêtre
(E. Anglés-Cano)

Haut de page

Publications dans des revues

S. Lorthois et  P.-Y. Lagrée : Ecoulement dans un convergent axisymétrique : calcul de la contrainte de cisaillement pariétale maximale, Comptes Rendus de l’Académie des Sciences, Série IIb 2000 : 328, 33-40.
S. Lorthois, P.-Y. Lagrée, J.-P. Marc-Vergnes et F. Cassot : Maximal wall shear stress in arterial stenoses : application to the internal carotid arteries, ASME Journal of Biomechanical Engineering 2000 : 122, 661-666.
S. Lorthois, P. Schmitz et  E. Anglés Cano : Experimental study of fibrin embolization under shear flow, Journal of Adhesion 2000 : 72, 229-239.
S. Lorthois, P. Schmitz et E. Anglés Cano : Experimental study of fibrin/fibrin specific molecular interactions using a sphere/plane adhesion model, Journal of Colloid and Interface Science 2001 : 241, 52-62.
M. Mercier-Bonin, K. Ouazzani, P. Schmitz, S. Lorthois : Study of bioadhesion on a flat plate with a yeast/glass model system, Journal of Colloid and Interface Science 2004 : 271, 342-350.
P.Y. Lagrée et S. Lorthois : The RNS Prandtl equations and their link with other asymptotic descriptions : application to the wall shear stress scaling in a constricted pipe, International Journal of Engineering Science, 2005 : 43, 352-378.
S. Lorthois, J.S. Stroud-Rossman, S.A Berger, L.D. Jou and D. Saloner : Numerical simulation of Magnetic Resonance Angiographies of an anatomically realistic stenotic carotid bifurcation, Annals of Biomedical Engineering, 2005 : 33, 270-283.
M.  Adoue, P.  Bacchin, S. Lorthois, D. Combes, P.  Schmitz and M. Mercier-Bonin : Methodology for analysing macromolecular interactions in the context of marine bacterial  adhesion to stainless steel, Chemical Engineering Research and Design, 2007 : 85(A6), 792-799.
G. Guillemot, S. Lorthois, P. Schmitz and M. Mercier-Bonin. “Evaluating adhesion force between Saccharomyces cerevisiae yeast cells and polystyrene from shear-flow induced detachment experiments”, Chemical Engineering Research and Design, 2007 : 85(A6), 800-807.
A. Al-Kilani, S. Lorthois,  T.-H. Nguyen, F. Le Noble,  A. Cornelissen,  M. Unbekandt,  O. Boryskina, L. Leroy and V. Fleury. “During vertebrate development, arteries exert a morphological control over the venous pattern through physical factors”, Physical Review E, 2008 : 77, 051912 (16 pages).

Actes de Congrès publiés dans des revues

S. Lorthois, D. Houi et E. Anglés-Cano. « Design of an experimental set-up for studying fibrin embolisation under shear flow conditions », Journal of Biomechanics 1998 ; 31 (S.1) : p79 (A).
S. Lorthois, F. Cassot et J.P. Marc-Vergnes. « Taux de cisaillement pariétal maximal dans une sténose carotidienne et fonctionnalité du cercle de Willis », Archives of Physiology and Biochemistry 1998 ; 106 (S.B) : p111 (A).
P.-Y. Lagrée, et S. Lorthois : « Interacting boundary layer flow in a stenosis », Archives of Physiology and Biochemistry 1999 ; Vol 107 : p51 (A).
S. Lorthois, F. Cassot et J.P. Marc-Vergnes : « Maximum wall shear stress in carotid stenoses », Cerebrovascular Diseases 1999 ; 9 (S.1) : pp. 22 (A).
S. Lorthois, P. Schmitz et E. Anglés-Cano : « Experimental estimation of fibrin/fibrin elastic force at rupture », Supplément à la revue « Le vide : science, technique et application » 2000 ; 296 (2/4) : 11-15.
B. de Bruin, P.-Y. Lagrée, S. Lorthois, C. Vilain, A. Veldman : « Comparison of Navier Stokes and Reduced Navier Stokes unsteady computations in a stenosis », Archives of Physiology and Biochemistry 2001 ; 109, p79 (A).
S. Lorthois, J.S. Stroud, S.A. Berger, L.D. Jou, D. Saloner : « Numerical simulation of magnetic resonance angiographies (MRA) of severely stenotic carotid artery bifurcations with realistic shapes », Archives of Physiology and Biochemistry 2002 ; 110 (Supplement September), p78 (A).
M. Castets, S. Lorthois et F. Cassot : « Toward a model of the BOLD effect accounting for microvascular heterogeneity », Archives of Physiology and Biochemistry 2004 ; 112 (Supplement September), p94 (A).
S. Lorthois, F. Cassot et F. Lauwers : « Numerical simulation of blood flow in large microvascular networks of the human cerebral cortex : hemodynamic variations induced by arteriolar vasodilations », Journal of Vascular Research 2006 ; 43(S1), p42 (A).
A. Al-Kilani, S. Lorthois, T.H. Nguyen, F. Le Noble,  A. Cornelissen, L. Leroy and V. Fleury : How arteries directly control the venous pattern through mechanical factors during vascular morphogenesis, Journal of Vascular Research 2008 ; 45(S2), p61 (A).
I. Billanou,S. Lorthois and M. Quintard : A new experimental set-up for the study of tracer exchange between a network of channels and a diffusive matrix: application to kinetic modelling in PET, Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering 2008 ; 11(S1), 35 – 36.

Haut de page

Publications dans des ouvrages

F. Cassot, S. Lorthois et M. Zagzoule : Microvascular networks. In : Verdonk P. (Edt.) Intra and extracorporeal cardiovascular fluid dynamics, Advances in Fluid Mechanics Series, 1998, Southampton, WIT Press
S. Lorthois et P. Schmitz : « Removal of fibrin coated particles from surfaces », In : Mittal K.L. (Edt) Particles on Surfaces 7 : Detection, Adhesion and Removal, 2002, V.S.P. Intl Science, pp. 305-404.

Haut de page

Congrès Internationaux

F. Cassot, S. Lorthois, P. Augros et J.P. Marc-Vergnes. « The interaction between vascular structure and blood flow in a cerebral microvascular network », Fluid-structure interactions in biomechanics, Euromech 344. Londres, Avril 1996.
S. Lorthois, D. Houi et E. Anglés-Cano. « Design of an experimental set-up for studying fibrin embolisation under shear flow conditions », 11ème conférence de l' »European Society of Biomechanics ». Toulouse, Juillet 1998.
S. Lorthois, D. Houi, P. Schmitz et E. Anglés-Cano : « Experimental study of fibrin embolization under shear flow », 22ème congrès de l' »Adhesion Society ». Panama City Beach, Floride, Février 1999.
S. Lorthois, F. Cassot et J.P. Marc-Vergnes : « Maximum wall shear stress in carotid stenoses », 8th European Stroke Conference. Venise, Italie, Avril 1999.
S. Lorthois, P. Schmitz, D. Houi, E. Anglés-Cano, F. Cassot et J.P. Marc-Vergnes : « Maximal wall shear stress in a carotid stenosis and effect on fibrin fragments embolization », Physiological flows and flow-structure interactions, Euromech 389. Graz, Autriche, Avril 1999.
S. Lorthois, P. Schmitz et E. Anglés-Cano : « Study of fibrin/fibrin interactions using a hydrodynamic method », 23ème congrès de l' »Adhesion Society ». Myrtle Beach, Caroline du sud, Février 2000.
S. Lorthois and P. Schmitz : « Removal of fibrin coated particles from surfaces », 7th International Symposium on particles on surfaces: detection, adhesion and removal, Newark, Juin 2000.
S. Lorthois, F. Cassot, J.P. Marc-Vergnes et P.Y. Lagrée : « Maximal wall shear stress in carotid stenoses and functionality of the circle of Willis », 20th International Congress of Theoretical and Applied Mechanics (ICTAM 2000), Chicago, Aout 2000.
S. Lorthois, P. Schmitz et E. Anglés-Cano : « Experimental estimation of fibrin/fibrin elastic force at rupture », 5th European Conference on Adhesion (EURADH’2000), Lyon, Septembre 2000.
P.Y. Lagrée et S. Lorthois : « Reduced Navier Stokes in axisymetrical stenoses », 4th EUROMECH Fluid Mechanics Conference (EFMC2000), Eindhoven, Novembre 2000.
S. Lorthois, J.S. Stroud, S.A. Berger, L.D. Jou, D. Saloner : « Numerical simulation of time of flight (TOF) magnetic resonance angiographies (MRA) of severely stenotic carotid artery bifurcations with realistic shapes », International Society of Biomechanics 28th Congress, Zürich, Juillet 2001.
(P) M. Castets, I. Gilliéron, S. Lorthois et F. Cassot : « An Eulerian approach for the transport of magnetization in functional brain MR imaging », 5th EUROMECH Fluid Mechanics Conference (EFMC2003), Toulouse, Aout 2003.
S. Lorthois, F. Cassot et F. Lauwers : « Numerical simulation of blood flow in large microvascular networks of the human cerebral cortex : hemodynamic variations induced by arteriolar vasodilations », 24th European Conference on Microcirculation, Amsterdam, Aout 2006.
A. Al-Kilani, T.H. Nguyen, S. Lorthois, F. Le Noble, A. Cornelissen, L. Leroy et V. Fleury : Mechanical factors control the transformation of the cis-cis to cis-trans vascular configuration, The 7th ESH Euroconference on Angiogenesis, Albufeira, Portugal, May 2007.
A. Al-Kilani, S. Lorthois, T.H. Nguyen, F. Le Noble,  A. Cornelissen, L. Leroy and V. Fleury : How arteries directly control the venous pattern through mechanical  factors during vascular morphogenesis, 25th European Conference on Microcirculation, Budapest, Hongrie, Aout 2008.

Haut de page

Congrès Nationaux

S. Lorthois, F. Cassot et J.P. Marc-Vergnes. « Taux de cisaillement pariétal maximal dans une sténose carotidienne et fonctionnalité du cercle de Willis », 23ème congrès de la Société de Biomécanique. Lyon, Septembre 1998.
S. Lorthois, P.-Y. Lagrée, F. Cassot, et J.-P. Marc-Vergnes : « Contrainte de cisaillement pariétale maximale dans une sténose artérielle », 14ème Congrès Français de Mécanique. Toulouse, Août 1999.
S. Lorthois, P. Schmitz, D. Houi, et E. Anglés-Cano : « Embolisation d’un caillot de fibrine en écoulement cisaillé : modèle expérimental », 14ème Congrès Français de Mécanique. Toulouse, Août 1999.
P.-Y. Lagrée, et S. Lorthois : « Interacting boundary layer flow in a stenosis », 24ème congrès de la Société de Biomécanique. Beaune, Septembre 1999.
B. de Bruin, P.-Y. Lagrée, S. Lorthois, C. Vilain, A. Veldman : « Comparison of Navier Stokes and Reduced Navier Stokes unsteady computation in a stenosis », 26ème congrès de la Société de Biomécanique. Marseille, Septembre 2001.
S. Lorthois, J.S. Stroud, S.A. Berger, L.D. Jou, D. Saloner : « Numerical simulation of time of flight (TOF) magnetic resonance angiographies (MRA) of severely stenotic carotid artery bifurcations with realistic shapes », 27ème congrès de la Société de Biomécanique. Valenciennes, Septembre 2002.
M. Mercier-Bonin, K. Ouazzani, P. Schmitz et S. Lorthois : Adhésion de levures de boulangerie sur une plaque de verre : influence des conditions environnementales. PROSETIA 2003, Rennes, Mars 2003.
I. Gilliéron, S. Lorthois et F. Cassot : « Etude du transport de l’aimantation dans un capillaire sanguin rectiligne en IRMf », 16ème Congrès Français de Mécanique. Nice, Septembre 2003.
M. Castets, S. Lorthois et F. Cassot : « Transport de l’aimantation en microcirculation sanguine : résolution du problème microscopique », 6ème Journées Milieux Poreux. Toulouse, Novembre 2003.
G. Guillemot, M. Mercier-Bonin, S. Lorthois, P. Schmitz : « Adhésion de la levure Saccharomyces cerevisiae sur une plaque d’acier inoxydable : influence des  caractéristiques énergétiques du microorganisme et du support ». PROSETIA 2004, Toulouse, Mars 2004.
M. Castets, S. Lorthois et F. Cassot : « Toward a model of the BOLD effect accounting for microvascular heterogeneity », 28ème congrès de la Société de Biomécanique. Créteil, Septembre 2004.
G. Guillemot, G. Vaca, B. Boissier, S. Lorthois, P. Schmitz, A. Vernhet et M. Mercier-Bonin : « Adhesion de saccharomyces cerevisiae sur differents supports : incidence de l’état physiologique des cellules et de la nature du support ». PROSETIA 2005, Villeneuve d’Ascq, Mars 2005.
G. Guillemot, M. Mercier-Bonin, H. Martin-Yken, S. Lorthois et P. Schmitz : « Adhésion de la levure Saccharomyces cerevisiae sur une plaque d’acier inoxydable : application à l’hygiène des surfaces solides », 10ème Colloque de la Société Française de Génie des Procédés, Toulouse, France, Septembre 2005.
G. Guillemot, A. Vernhet, S. Lorthois, P. Schmitz et M. Mercier-Bonin : « Mécanismes biologiques et physiques impliques dans l’adhésion de la levure Saccharomyces cerevisiae sur l’acier inoxydable », 11ème Colloque Prosétia, Paris, France, 13-14 mars 2006.
I. Billanou, P. Duru, S. Lorthois, D. Bourrier et M. Dilhan. “Flow of concentrated red blood cells suspensions in micro-channels : experimental techniques”, 3ème Congrès Français de Microfluidique, Toulouse, France, Décembre 2006.
I. Billanou, S. Lorthois et M. Quintard. “A new experimental set-up for the study of tracer exchange between a network of channels and a diffusive matrix: application to kinetic modelling in PET. » 33ème congrès de la Société de Biomécanique. Compiègne, Septembre 2008.

Cerebral micro-vascular networks

DOI: 10.1051/meca/2009061

Le réseau micro-vasculaire structure la distribution de la pression sanguine

Romain Guibert1, 2, 3, 4, Caroline Fonta3, 4 et Franck Plouraboué1, 2

1 Université de Toulouse, INPT, UPS, IMFT (Institut de Mécanique des Fluides de Toulouse), Allée Camille Soula, 31400 Toulouse, France
2 CNRS, IMFT, 31400 Toulouse, France
3 Université de Toulouse, UPS, Centre de Recherche Cerveau et Cognition, 31400 Toulouse, France
4 CNRS, CerCo, 31400 Toulouse, France


Reçu le 20 avril 2009 / Publié en ligne 5 août 2009

Abstract – Cerebral micro-vascular networks control the blood pressure distribution when considering in vitro blood rheology models. Blood rheology is complex and non-linear. In small vessels, the effective viscosity variations are important due to red blood cells packing in capillaries, the so-called Fåhræus-Lindquist effect, whilst concomitantly phase segregation appears in bifurcations. Direct numerical simulations of different non-linear rheological models of the blood are performed on realistic three-dimensional micro-vascular networks. These simulations exhibit two significant results. First, various rheological models lead to very similar pressure distribution over the whole range of physiologically relevant hematocrits. Secondly, different models for phase segregation lead to very distinct hematocrit distributions in the micro-vacular network. Nevertheless, the hematocrit distribution very weakly affects the pressure distribution. Hence, our results suggest that the micro-vacular network structure mainly controls the pressure distribution in micro-circulation, whilst the effect of hematocrit distribution is weak.

Résumé – La rhéologie sanguine est complexe et non-linéaire. Elle présente, dans les plus petits vaisseaux, des variations de viscosité effective importantes liées au confinement des globules rouges dans les capillaires et des dissymétries de répartition des globules rouges aux bifurcations. Ces deux effets, appelés effet Fåhræus-Lindquist et ségrégation de phase, conduisent à une modélisation non-linéaire du flux sanguin en réponse à une différence de pression imposée. Le calcul numérique complet de différents modèles non-linéaires de rhéologie sanguine, dans des géométries réelles tridimensionnelles de micro-réseaux vasculaires, permet d’exhiber certaines propriétés remarquables de ces écoulements et de ces modèles. D’une part, nous constatons que différents modèles conduisent à des répartitions de la pression sanguine très proches, pour une gamme d’hématocrite systémique imposée physiologique. D’autre part, différents modèles de ségrégation de phase conduisent à des répartitions d’hématocrite très différentes. Toutefois, la répartition de l’hématocrite n’affecte que très faiblement la répartition de la pression. Ce constat nous montre que c’est la micro-structure vasculaire qui impose la distribution de pression, alors que les variations de viscosité sanguine avec l’hématocrite impactent finalement faiblement sur cette distribution.

Key words: Micro-circulation / blood rheology / Fåhræus-Lindquist effect / cortex / apparent viscosity / phase separation / micro-tomography

Mots clés : Micro-circulation / rhéologie sanguine / effet Fåhræus-Lindquist / cortex / viscosité apparente  / séparation de phase / micro-tomographie

Corresponding author: Romain.Guibert@imft.fr

© AFM, EDP Sciences 2009 //


I MOVED THIS BLOG FROM WORDPRESS TO BLOGGER. Ce blog est à
ex-ample.blogspot.com

Blog Stats

  • 221 100 hits

localization

Flickr Photos

septembre 2009
L M M J V S D
« Août   Oct »
 123456
78910111213
14151617181920
21222324252627
282930