-
Curr Protoc Cell Biol. 2008 Jun;Chapter 4:Unit 4.19.
-
Quantitative colocalization analysis of confocal fluorescence microscopy images.
Department of Anatomy and Cell Biology, Kochi University, Faculty of Medicine, Japan.
Colocalization is an important finding in many cell biological studies. This unit describes a protocol for quantitative evaluation of images with colocalization based on the calculation of a number of specialized coefficients. First, images of double-stained sections are subjected to background correction. Then, various coefficients are calculated. Meanings of the coefficients and a guide to interpretation of their results indicating either presence or absence of colocalization are given. Success in colocalization studies depends on the quality of analyzed images, proper preparation of them for coefficients calculations, and correct interpretation of obtained results. This protocol helps to ensure reliability of colocalization coefficients calculations. Copyright 2008 by John Wiley & Sons, Inc.
var Menu18493666 = [
[« UseLocalConfig », « jsmenu3Config », « », « »],
[« LinkOut », « window.top.location=’/sites/entrez?Cmd=ShowLinkOut&Db=pubmed&TermToSearch=18493666&ordinalpos=2&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum’ « , « », « »]
]
–>Links
var Menu18353895 = [
[« UseLocalConfig », « jsmenu3Config », « », « »],
[« LinkOut », « window.top.location=’/sites/entrez?Cmd=ShowLinkOut&Db=pubmed&TermToSearch=18353895&ordinalpos=4&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum’ « , « », « »]
]
–>Links
var Menu18326662 = [
[« UseLocalConfig », « jsmenu3Config », « », « »],
[« LinkOut », « window.top.location=’/sites/entrez?Cmd=ShowLinkOut&Db=pubmed&TermToSearch=18326662&ordinalpos=5&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum’ « , « », « »]
]
–>Links
var Menu18312726 = [
[« UseLocalConfig », « jsmenu3Config », « », « »],
[« Compound (MeSH Keyword) » , « window.top.location=’/sites/entrez?Db=pccompound&DbFrom=pubmed&Cmd=Link&LinkName=pubmed_pccompound_mesh&LinkReadableName=Compound%20(MeSH%20Keyword)&IdsFromResult=18312726&ordinalpos=6&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum’ « , « », « »],
[« Substance (MeSH Keyword) » , « window.top.location=’/sites/entrez?Db=pcsubstance&DbFrom=pubmed&Cmd=Link&LinkName=pubmed_pcsubstance_mesh&LinkReadableName=Substance%20(MeSH%20Keyword)&IdsFromResult=18312726&ordinalpos=6&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum’ « , « », « »],
[« LinkOut », « window.top.location=’/sites/entrez?Cmd=ShowLinkOut&Db=pubmed&TermToSearch=18312726&ordinalpos=6&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum’ « , « », « »]
]
–>Links
var Menu18262520 = [
[« UseLocalConfig », « jsmenu3Config », « », « »],
[« Compound (MeSH Keyword) » , « window.top.location=’/sites/entrez?Db=pccompound&DbFrom=pubmed&Cmd=Link&LinkName=pubmed_pccompound_mesh&LinkReadableName=Compound%20(MeSH%20Keyword)&IdsFromResult=18262520&ordinalpos=7&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum’ « , « », « »],
[« Substance (MeSH Keyword) » , « window.top.location=’/sites/entrez?Db=pcsubstance&DbFrom=pubmed&Cmd=Link&LinkName=pubmed_pcsubstance_mesh&LinkReadableName=Substance%20(MeSH%20Keyword)&IdsFromResult=18262520&ordinalpos=7&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum’ « , « », « »],
[« LinkOut », « window.top.location=’/sites/entrez?Cmd=ShowLinkOut&Db=pubmed&TermToSearch=18262520&ordinalpos=7&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum’ « , « », « »]
]
–>Links
var Menu18243164 = [
[« UseLocalConfig », « jsmenu3Config », « », « »],
[« Compound (MeSH Keyword) » , « window.top.location=’/sites/entrez?Db=pccompound&DbFrom=pubmed&Cmd=Link&LinkName=pubmed_pccompound_mesh&LinkReadableName=Compound%20(MeSH%20Keyword)&IdsFromResult=18243164&ordinalpos=8&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum’ « , « », « »],
[« Substance (MeSH Keyword) » , « window.top.location=’/sites/entrez?Db=pcsubstance&DbFrom=pubmed&Cmd=Link&LinkName=pubmed_pcsubstance_mesh&LinkReadableName=Substance%20(MeSH%20Keyword)&IdsFromResult=18243164&ordinalpos=8&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum’ « , « », « »],
[« LinkOut », « window.top.location=’/sites/entrez?Cmd=ShowLinkOut&Db=pubmed&TermToSearch=18243164&ordinalpos=8&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum’ « , « », « »]
]
–>Links
var Menu18089858 = [
[« UseLocalConfig », « jsmenu3Config », « », « »],
[« LinkOut », « window.top.location=’/sites/entrez?Cmd=ShowLinkOut&Db=pubmed&TermToSearch=18089858&ordinalpos=9&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum’ « , « », « »]
]
–>Links
var Menu18007619 = [
[« UseLocalConfig », « jsmenu3Config », « », « »],
[« LinkOut », « window.top.location=’/sites/entrez?Cmd=ShowLinkOut&Db=pubmed&TermToSearch=18007619&ordinalpos=10&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum’ « , « », « »]
]
–>Links
—article of Suzanne, Gif:
Bolte S., and Cordelieres F. (2006) A guided tour into subcellular colocalization analysis in light microscopy. J Microsc. 2006 Dec;224(Pt 3):213-32.
Commentaires récents